简要描述: 利用Cas12a(Cpf1)实现crRNA引导的基因编辑。
基本原理:
Cas12a识别TTTV型PAM → 切割DNA产生5'粘性末端。
操作步骤 (细胞转染):
crRNA设计:靶向序列(长度42-44nt)+ 直接重复序列。
复合体组装:Cas12a蛋白 + crRNA(37℃ 10min)。
递送:
贴壁细胞:脂质体转染
难转染细胞:电穿孔(1500V, 10ms)
编辑效率检测:T7E1酶切或二代测序。
应用范围:
AT-rich区域编辑(Cas12a PAM要求低)。
多重编辑(单个crRNA阵列靶向多基因)。
注意事项:
与Cas9比较:
| 特性 | Cas12a | Cas9 |
|---|---|---|
| PAM | 5'-TTTV | 5'-NGG |
| 切割末端 | 5' overhang | blunt end |
| crRNA长度 | 42-44 nt | 20 nt |